عنوان مقاله: تأثیر سناریو¬های تعیین ژنوتیپ روی صحت پیش¬بینی ژنومی در گوسفند با استفاده از شبیه¬سازی
شناسه مقاله: 1-39-2026نویسندگان: رضا سید شریفی ، مریم اسرافیلی تازه کندمحمدیه ،
این پژوهش با هدف ارزیابی سناریوهای تعیین ژنوتیپ روی صحت پیش¬بینی در گوسفند با در نظر گرفتن محدودیت¬هایی برای در دسترس بودن اطلاعات فنوتیپی و ژنومی انجام شد. برای این منظور، با تقلید از سیستم ارزیابی ژنتیکی گوسفند، یک جمعیت چند نژادی از گوسفند شبیه¬سازی شد. چهار سناریو تعیین ژنوتیپ با ارزیابی مبتنی بر شجره مقایسه شد. در هر سناریو ژنوتیپ جهت بررسی تأثیر رکورد فنوتیپی روی صحت پیش¬بینی، 9 حالت برای وجود رکورد فنوتیپی بر اساس سه فرض (وجود رکورد فنوتیپی برای نرها و ماده¬ها، ماده¬ها و نرها) در نظر گرفته شد. برای شبیه¬سازی، اعمال سناریوهای مختلف و برآورد ارزش اصلاحی به ترتیب از نرم¬افزارهای QMSim، R و DMU استفاده گردید. نتایج حاکی از بهبود صحت پیش¬بینی با استفاده از اطلاعات ژنومی بود، حتی زمانی که تعداد محدودی از حیوانات ژنوتیپ شده باشند (یعنی 74/4 درصد از کل حیوانات در ارزیابی ژنتیکی). مقایسه سناریوهای مختلف ژنوتیپ نشان داد که، تعیین ژنوتیپ بدون در نظر گرفتن محدودیت کمترین صحت پیش¬بینی را دارد. علاوه بر این، تعیین ژنوتیپ میش¬ها صحت پیش¬بینی کمتر و تعیین ژنوتیپ میش¬ها و قوچ¬ها باهم صحت پیش¬بینی متوسطی را به همراه دارد. نتایج این پژوهش نشان داد که، برای دستیابی به بالاترین صحت پیش¬بینی لازم نیست همه حیوانات رکورد فنوتیپی و ژنوتیپی داشته باشند و می¬توان با تعیین ژنوتیپ و فنوتیپ انتخابی ضمن کاهش هزینه¬های انتخاب ژنومی به بالاترین صحت پیش¬بینی دست یافت.
کلمات کلیدی:ارزیابی ژنتیکی، سناریو، صحت.